恩主公醫院中醫內科由專業中醫師團隊提供內科、婦科、兒科全方位的診療，有獨立看診及治療空間，以及注重隱私的諮詢/衛教空間，提供民眾舒適的就醫環境。能與本院西醫就診紀錄、抽血檢查、影像報告同步連線，進行中西醫整合治療，並具有專業藥師團隊提供多樣化中藥藥事服務，提供科學中藥藥品調劑、藥材配製、藥水代煎、中西藥藥物諮詢及臨床藥事等服務。
- 內科:
1.過敏性疾病(過敏性鼻炎、氣喘、慢性咳嗽、異位性皮膚炎)
2.腸胃功能條理(便秘、腹瀉、消化不良、腸躁症)、肝膽疾病(脂肪肝，膽結石等)
3.風濕免疫疾病(乾燥症、類風濕性關節炎、乾癬、紅斑性狼瘡)
4.癌症體質調理、攝護腺肥大、慢性腎臟疾病
5.失眠、憂鬱症，睡眠障礙、精神官能症(身心症、恐慌症、焦慮症)以及情緒疾患(憂鬱症、躁鬱症、婦女更年期情緒疾患)
6.中醫眼科(乾眼症、視力模糊、青光眼、視網膜病變) - 婦科:
1.婦科體質調理(經痛、更年期症候群)
2.不孕症
3.產後調理(月子方)
4.婦女泌尿系統疾患(頻尿、反覆泌尿道感染、婦女更年期後泌尿道疾患) - 兒科:
1.兒童、青少年生長發育、性早熟及青春期調理
2.兒童、青少年呼吸道過敏及相關皮膚疾病
3.兒童及青少年心智疾患(注意力不足過動症、妥瑞氏症、自閉症、亞斯伯格症、青少年情緒及精神障礙) - 社區醫療：
1.居家照護
2.機構巡診
3.產後護理之家巡診
4.健檢中心（十二經絡能量檢測）
- 安心中藥水煎藥服務
本部定期送檢中藥材，均符合衛生福利部之規範，請民眾安心服用。由多年看診經驗資深中醫師群調配符合個人體質之月子方、轉骨方，並提供代煎煮服務，方便民眾飲用。
- 特色茶飲
本部依據四季節氣，特別調配適合各季節飲用之養生茶飲，包含理氣化濕的春荷茶、生津清暑的夏郁茶、潤肺健脾胃的秋容茶以及促進循環的冬煦茶。並針對不同需求之民眾提供調整身體代謝的纖美茶、潤喉開嗓的美聲茶、安養心神的舒眠茶和益氣扶正的防疫茶等。
科學中藥調配: 使用的科學中藥和中藥材皆為台灣GMP大廠，並經過SGS檢驗，確保不含重金屬及異常物質。並全面使用安全檢核調劑系統(Electric Barcode Check System，EBCS)，運用二代條碼，將科學中藥從生產製造到調劑進行品質管理並留下紀錄，確保民眾用藥安全。
製劑室: 整潔明亮、設備完善的製劑室，提供客制化中藥水劑代煎煮服務。
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| 序號 | 文件名稱 | 類別 |
|---|---|---|
| 1 | 過敏性鼻炎之照護 | 中醫內科 |
| 2 | 高血壓之照護 | 中醫內科 |
| 3 | 骨質疏鬆之保健 | 中醫內科 |
| 4 | 氣喘之防治 | 中醫內科 |
| 5 | 失眠患者之調理 | 中醫內科 |
| 6 | 青春痘之調理 | 中醫內科 |
| 7 | 乾癬的中醫衛教指導 | 中醫內科 |
| 8 | 便秘 | 中醫內科 |
| 9 | 白帶患者之日常生活照顧 | 中醫婦科 |
| 10 | 中醫產後護理指導 | 中醫婦科 |
| 11 | 寒熱體質的差異 | 中醫內科 |
| 12 | 各種疾病的飲食禁忌 | 中醫內科 |
| 13 | 食物屬性表 | 中醫內科 |
| 14 | 穴位敷貼-三伏貼.三九貼 | 穴位敷貼 |
| 15 | 女人二三四 失眠誰人知 | 中醫婦科 |
| 16 | 中醫抗癌面面觀 | 中醫內科 |
| 17 | 中醫看退化性關節炎 | 中醫內科 |
| 18 | 身體亮黃燈-淺談身心症的中醫觀點及治療 | 中醫內科 |
| 19 | 氣喘的中醫治療與保健 | 中醫內科 |
| 20 | 淺談大腸激躁症的中、西醫觀點 | 中醫內科 |
| 21 | 淺談小兒厭食的中醫治療 | 中醫兒科 |
| 22 | 淺談不孕症的中醫觀點 | 中醫婦科 |
| 23 | 淺談注意力不集中及過動症的中醫觀點 | 中醫兒科 |
| 24 | 淺談鼻竇炎的中醫預防與治療 | 中醫內科 |
| 25 | 順腸人生 | 中醫內科 |
| 26 | 過敏性鼻炎的中醫治療與保健 | 中醫內科 |
| 27 | 過敏的中醫保健 | 中醫內科 |
| 28 | 良好睡眠三大生活公約 | 中醫內科 |
| 29 | 科學中藥服用及保存方式 | 中醫藥品 |
| 30 | 中醫外用藥膏使用介紹 | 中醫藥品 |
| 31 | 中藥藥材煎煮法 | 中醫藥品 |
| 32 | 什麼是藥丸 | 中醫藥品 |
| 33 | 慢性腎炎與腎衰竭 | 中醫內科 |