教學的啟用是傳承的開始，醫學教育的目標在於承先啟後，培育具備醫學論理與專業技能的醫師。
恩主公醫院設計務實可行之教學訓內容，可供臨床醫療單位充分運用，並制訂具體訓練目標及核心能力要求，注重互動、啟發式教學，以病人為中心，注重醫病關係及溝通技巧，臨床實證醫學教育及受訓者學習時間有受到保護，而且有合理的工作量，致力於培養具有專業知識與技能並能靈活運用之專業醫療人才。
為建立系統性的牙醫師臨床訓練制度，銜接學校教育與臨床服務，進而提升全國牙醫師畢業後之訓練品質及成果，培育優秀牙醫人才，增進醫療品質，故推動二年期牙醫師畢業後一般醫學訓練計畫。依據醫療法第18條規定：「醫療機構應置負責醫師一人，對其機構醫療業務，負督導責任。私立醫療機構， 並以其申請人為負責醫師。前項負責醫師，以在中央主管機關指定之醫院、診所接受二年以上之醫師訓練並 取得證明文件者為限。」
本院以期在服務病患、發展教學研究及配合衛福部相關醫療政策，能提供更進步、完整的醫療、教學服務，並使各專科不論教學素材或臨床經驗都一直保持區域教學醫院的水準。
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